НовостиКаждому раку по подтипу!

Группа исследователей из Хэфэйского института интеллектуальных машин и физических наук представляет CancerSubtypes - пакет для языка R, который обеспечивает функционал для удобной идентификации подтипов рака, используя данные экспрессии генов, мультиомные исследования и другие виды данных.

Подробнее
0

РазноеВакансия постдока в СПбГУ

В лаборатории «Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского» СПбГУ объявляется конкурс на ставку «постдока». Тема исследования: «Сравнительная геномика Mycobacterium tuberculosis: оптимизация базы данных геномных вариантов и разработка аналитических инструментов».

Подробнее
0

НовостиПредсказание неоантигенов в облаках

Авторы из The Jackson Laboratory  Геномной Медицины представляют CloudNeo облачный вычислительный пайплайн для идентификации пациент-специфических опухолевых неоатнигенов (neoantigens) по данным секвенирования NGS.
Подробнее
+2

НовостиПодведем итоги по нанопорам

В данном обзоре группа авторов из департамента клинической медицины Флорентийского университета сталкивается с основными вычислительными задачами, связанными с анализом данных, полученных от секвенаторов MiniON
Подробнее
+1

НовостиВглубь половых клеток

Группа исследователей из Пекинского центра инновационных геномных исследований  провели секвенирование РНК одиночных клеток на более чем 2000 FGCs и их половыми клетками из реальных человеческих женских и мужских эмбрионов на разных стадиях развития.
Подробнее
0

НовостиМного экспериментов, много QC

Много экспериментов, много QC

 

Исследователи из Северо-Западной лаборатории США решили некоторые из этих недостатков путем агрегации и визуализаций данных в расширяемой и интерактивное программное решение FQC Dashboard, которое упрощает идентификацию мест ошибок  в экспериментах, а также генерируют метрики качества для данных, используемые исследователями для анализа.

Подробнее
0

НовостиКластеризовали-кластеризовали, да не выкластеризовали...

В этой статье авторы из Университета Луисвилля представить пакет R под названием optCluster, чтобы помочь исследователям установить оптимальное или «лучшее» решение для кластерного анализа.
Подробнее
0

НовостиНасколько ты хорош, scRNA-Seq?


Исследователи из Университета Падуи обсуждают в статье результаты, полученные на двух настоящих и одном синтетическом наборах данных, наряду с соображениями о перспективах анализа дифференциальной экспрессии геновв секвенировани одиночных клеток.

Подробнее
0

НовостиДжедай контроля качества


Для облегчения анализа Spike-in контролей в данных NGS, группа ученых из  Института медицинских исследований Сиднея разработала программный инструмент,  названный ANAQUIN. Этот инструмент позволяет пользователям оценить качество Spike-in контролей и экспериментальный образец РНК / ДНК.

Подробнее
0