НовостиТранскрипты из стали

В данной статье исследователи из Королевской детской больницы в Мельбурне, представляют понятие "супертранскрипты", заменяющие референсный геном, где каждый ген с несколькими транскриптами представлен одной последовательностью.
Подробнее
0

НовостиИскать микросателлиты в вебе

 
MISA - представляет собой инструмент для поиска микросателлитов в нуклеотидных последовательностях. Исследователи из Лейбницского института генетики растений и исследований растениеводческих растений представляют MISA-web, расширение для инструмента командной строки MISA, которое предоставляет графический пользовательский интерфейс и выходные данные в  формате GFF3.
Подробнее
0

НовостиГенные сети и кукуруза.


Исследователи из Университета штата Флорида оценивали параметры для нормализации данных экспрессии и построения различных видов генных сетей на основе анализа данных РНК-секвенирования кукурузы!
Подробнее
0

НовостиНе забудь посчитать изоформы!


В данном обзоре авторы провели всестороннюю оценку биоинформатических инструментов анализа изоформ транскриптов с использованием как экспериментальных, так и смоделированных наборов данных РНК-секвенирования.
Подробнее
0

НовостиБольшие данные для большой медицины


В этом обзоре авторы из Национального Института Инфекции а Аллергии выявляют несоответствия между нынешними подходами к управлению данными и необходимостью внедрения новых решений для управления большими данными, полученными в ходе масштабных исследований в сфере здравоохранения. Ориентируясь на эти неудовлетворенные потребности и общепризнанные проблемы, авторы рассматривают самые современные концепции, подходы и технологии для управления данными от вычислительных лабораторий и индустрии для изучения решений по их улучшению.
Подробнее
0

НовостиВидов РНК не бывает много.


Этот обзор поможет конечным пользователям и исследователям получить информацию о существующих базах данных и инструментах для работы с различными видами РНК, а также понять конкретные функции, которые они предлагают. 
Подробнее
0

НовостиИстория становления MRSA (микровсадники апокалипсиса)

История становления MRSA (микровсадники апокалипсиса)

 

Метициллин - бета-лактамный антибиотик пенициллинового ряда - вошел в практику после обнаружения устойчивости золотистого стафилококка к пенициллину, но появление резистентного штамма не заставило себя долго ждать: в 1960 году (всего через год после первого применения) были обнаружены штаммы S.aureus с устойчивостью к бета-лактамным антибиотикам, в частности к метициллину (MRSA - Methicillin-resistant Staphylococcus aureus).

 

По эпидемиологическим данным MRSA начал повсеместно распространяться после введения метициллина в клиническую практику. Исследователи из Сент-Эндрюсского университета и Института Сенгера отсеквенировали геномы 209 изолятов MRSA и нескольких изолятов метициллин-чувствительного золотистого стафилококка (MSSA - Methicillin-sensitive Staphylococcus aureus), собранных в Великобритании и Дании между 1960-1989 гг, для того, чтобы восстановить эволюционную историю устойчивости к метициллину.

Подробнее
0

НовостиМного видов секвенирования под капотом.


Исследователи с кафедры микробиологии Техасского университета разработали интегрированную платформу под названием CIPHER для системного анализа нескольких часто используемых наборов данных NGS, включая ChIP-seq, RNA-seq, MNase-seq, DNase-seq , GRO-seq и ATAC-seq.
Подробнее
0