НовостиЧем болеют митохондрии, и можно ли их вылечить?

Митохондриальные заболевания - группа наследственных патологий, приводящих к нарушению процесса окислительного фосфорилирования. Такие болезни вызываются мутациями в ядерных и митохондриальных генах, кодирующих белки, необходимые для нормального функционирования митохондрий.

Подробнее
+2

НовостиТёмная сторона протеома

Тёмная материя существует не только в астрофизике, но и в биологии. Мы до сих пор не знаем функции и происхождение огромного числа последовательностей в нашем собственном геноме. Кроме того, мы не знаем полную трёхмерную структуру, а значит и определяемые ей функциональные особенности, для половины известных эукариотических белков. Именно такие последовательности будут формировать тёмный протеом.

Подробнее
+2

СобытияМеждународная дистанционная олимпиада по биоинформатике

Отборочный тур пройдёт с 23 по 29 января 2017 года.

Финальный этап состоится 18-19 февраля 2017 года и будет длиться 24 часа, за которые участникам предстоит решить как можно больше биоинформатических заданий.

Для участия в олимпиаде желательно обладать знаниями в областях молекулярной биологии, геномики, информатики и машинного обучения.

Чтобы не забыть и не пропустить важную информацию, рекомендуем зарегистрироваться на сайте олимпиады.

Подробнее
+1

Новости / СофтCART - Chemical Annotation Retrieval Toolkit

К настоящему времени существуют десятки миллионов различных лекарственных препаратов. Многие из них имеют несколько синонимичных названий. А поиск известных биохимических и сигнальных эффектов для какого-нибудь лекарства может стать достаточно сложной задачей. Поэтому группа исследователей из Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) под руководством Samy Deghou разработала программу CART. Пользователь вводит название интересующего препарата, а утилита выдаёт все его названия-синонимы, перечень известных побочных эффектов, влияние на метаболические и сигнальные пути и области примененния.


Подробнее
+2

НовостиУстановлена причина "синдрома нерасчёсывающихся волос"

"Синдром нерасчесываемых волос" - редкая аномалия структуры стержня волоса, как правило проявляющаяся у детей и чаще всего исчезающая с возрастом - примерно в 15 лет. При этом заболевании волосы - сухие, вьющиеся, соломенного цвета, и их невозможно причесать. В первые данный синдром был описан в 1973 году A. Dupré, P. Rochiccioli и J.L. Bonafé во Франции. Предположение о том, что болезнь генетически детерменирована, было высказывано уже давно, однако до сих пор не было обнаружено ни одного гена, вовлеченного в её возникновение.

Подробнее
+3

РазноеСкрытые марковские модели и что они скрывают

Если перед вами стоит задача поиска гомологов какого-то гена, то не всегда можно обойтись всем хорошо известным, быстрым и удобным Blast. Дело в том, что он не видит удаленные гомологи, особенно при работаете с некодирующими последовательностями. Такой недостаток программы легко может привести к ложному результату. Например, если вам нужно узнать, когда впервые появляется интересующая вас последовательность, то Blast может серьёзно "омолодить" её, не обнаружив соответсвующие гомологи в удалённом таксоне. В подобном случае вам стоит обратить внимание на программы, использующие скрытые марковские модели. Пожалуй, самой известной среди таких программ является HMMER. Как и к почти любой другой программе, к ней прилагается очень подробное и user-friendly руководство, прочитав которое можно сразу же приступить к анализу вашей, безусловно интересной, последовательности. Однако для адекватной интерпретации выходных данных требуется представление о методе, лежащем в основе программы. Математические статьи и учебники могут быть очень сложны для восприятия (субъективное мнение редактора). Поэтому, предлагаем вашему вниманию две работы, в которых простым языком рассказывается, как работают скрытые марковские модели и от кого они скрываются.

Подробнее
+1

НовостиЗвучание белка - Squirell sounds

Не знаете, что послушать с утра? Весь плейлист уже наскучил? Тогда Robert P. Bywater из Института Фрэнсиса Крика и Jonathan N. Middleton из Университета Тампере могут предложить вам кое-что совсем новое! Исследователи решили, что мало визуализации третичной структуры белка, и неплохо было бы её послушать. Используя специальный алгоритм, они перевели в мелодию информацию о первичной и вторичной структурах, гидрофобности и растворимости трех белков. А дальше они решили узнать смогут ли испытуемые распознать какая мелодия соответствует тому или иному участку третичной структуры этих белков. Результат получился весьма неожиданным, - 73% участников эксперимента успешно справились с задачей. Теперь в планах исследователей "озвучить" и ДНК.

Подробнее
+3

НовостиКак ДНК из воды морской китовых акул считать помогала

Популяционно-генетические исследования необходимы для изучения и сохранения видов, находящихся под угрозой исчезновения. Однако, если вы имеете дело с редким видом, обитающим в океане, сбор матерала для анализа может оказаться непростой задачей. Но группа исследователей под руководством Eva Egelyng Sigsgaard из Музея Естественной истории Дании, анализируя выделенную из морской воды ДНК при помощи методов высокопроизводительного секвенирования, сумела не только определить степень гетерогенности популяции китовой акулы, но и оценить её численность.

Подробнее
+3