НовостиЗвучание белка - Squirell sounds

Не знаете, что послушать с утра? Весь плейлист уже наскучил? Тогда Robert P. Bywater из Института Фрэнсиса Крика и Jonathan N. Middleton из Университета Тампере могут предложить вам кое-что совсем новое! Исследователи решили, что мало визуализации третичной структуры белка, и неплохо было бы её послушать. Используя специальный алгоритм, они перевели в мелодию информацию о первичной и вторичной структурах, гидрофобности и растворимости трех белков. А дальше они решили узнать смогут ли испытуемые распознать какая мелодия соответствует тому или иному участку третичной структуры этих белков. Результат получился весьма неожиданным, - 73% участников эксперимента успешно справились с задачей. Теперь в планах исследователей "озвучить" и ДНК.

Подробнее
+3

НовостиКак ДНК из воды морской китовых акул считать помогала

Популяционно-генетические исследования необходимы для изучения и сохранения видов, находящихся под угрозой исчезновения. Однако, если вы имеете дело с редким видом, обитающим в океане, сбор матерала для анализа может оказаться непростой задачей. Но группа исследователей под руководством Eva Egelyng Sigsgaard из Музея Естественной истории Дании, анализируя выделенную из морской воды ДНК при помощи методов высокопроизводительного секвенирования, сумела не только определить степень гетерогенности популяции китовой акулы, но и оценить её численность.

Подробнее
+3

События / Курсы и семинарыEMBL Course: Analysis and Integration of Transcriptome and Proteome Data

С 13 по 18 марта на базе Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Гейдельберге пройдет практический курс по анализу транскриптомных и геномных данных.

Целевая аудитория курса - биологи, использующие методы NGS и масс-спектрометрию, но не являющиеся специалистами в этих областях. Задачей курса является знакомство с методами, которые часто используются в транскриптомных и протеомных исследованиях. Обучение будет проводиться с использованием данных, полученных в Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) при анализе как стволовых, так и дифференцированных клеток.

Подробнее
0

РазноеКак рассказать о своей работе на вечеринке, если ты биоинформатик

Интересные новости будут завтра, а пока держите немного лёгкого чтения. Думаю, многим из вас приходилось долго подбирать слова, отвечая на вопрос: "Хм... Биоинформатик... А, что ты, собственно, делаешь?". И не важно, где вы его услышите, от родственников или друзей в баре (кстати, ведь завтра пятница), всегда непросто решить с какого же края подступиться. Может, стоит начать с общей биологии? Или с математики? Как, в конце-концов, не потерять внимания собеседника, ведь хочется, чтобы он понял, что вы занимаетесь действительно интересными и важными вещами? А если диалог идет в большой компании родственников, то внимание к рассказу о вашей профессии особенно критично, ибо следующий вопрос будет о вашей личной жизни! Своеобразную инструкцию по преодолению вышеупомянутых трудностей предлагает Alicia Oshlack в своей статье "A 10-step guide to party conversation for bioinformaticians".

Подробнее
+1

РазноеТаблица биоинформатических элементов

Весьма нетривиальный и классный способ представления немаленького списка разнообразных биоинформатических тулов. Там вы сможете найти программы для выравнивания последовательностей, сборки геномов, моделирования третичной структуры белков и многое другое. Одним словом, отличное место! Вот редактор, например, там застрял и клацает по элементам, чего и вам желает.

Подробнее
+2

Новости / ГрантыКонкурс

Википедия стала одним из наиболее широко используемых источников научной информации в мире.Этот ресурс популярен как среди студентов, так и среди широкой общественности. С 2012 года ISCB проводит ежегодный конкурс статей Википедии, созданных студентами или стажерами, которые поддерживают образовательную миссию Общества вычислительной биологии (ISCB) и расширяют знания в области вычислительной биологии и биоинформатики в Википедии. Победители конкурса награждаются денежными призами, а также получают годовое членство в ISCB.

Подробнее
+2

НовостиГеном 5000-летнего початка рассказал о ранних этапах одомашнивания кукурузы


Одомашнивание предка современной кукурузы (Zea mays L. ssp. mays) началось в Мексике в промежутке от 6250 до 10000 лет назад. За тысячелетия искуственного отбора растение настолько сильно изменилось, что сейчас уже можно лишь догадываться о том, как должен был выглядеть его исходный дикий предок. На данный момент считается, что к предку современной кукурузы наиболее близки Zea mays ssp. parviglumis и Zea mays ssp. mexicana, часто обозначаемые под общим названием "теосинте".

Подробнее
0

ОбзорыМатематика и Big Data в современной медицине

С развитием информационных технологий и увеличением количества различных баз данных всё больше и больше исследований проводится, не отходя от ноутбука. Знаменитый популяризатор науки, Александр Марков, в своей книге “Рождение сложности”, справедливо отметил, что “поток новых открытий не иссякает. Наши представления об устройстве и развитии живой материи по-прежнему несовершенны и неполны. Теоретики не успевают осмыслить новые факты просто потому, что те слишком быстро накапливаются...

Подробнее
+4