НовостиИсследовать рак теперь удобно.

В представленной работе исследователи из Университета Алабамы в Бирмингеме представляют UALCAN - простой в использовании интерактивный веб-портал, который дает возможность выполнить глубокий анализ данных экспрессии генов TCGA.
Подробнее
0

НовостиВглубь транскриптомики рака


В данной работе исследователи из Медицинского центра Университета Небраски разработали новый метод поиска без выравнивания, ChimeRScope, который точно прогнозирует транскрипты слияния, основанный на профилях геномных отпечатков (например, k-меров) парных ридов в RNA-Seq.

Подробнее
0

НовостиКальмары для онкологии


Исследователи Университета Карнеги-Меллона разработали SQUID - новый алгоритм для того, чтобы точно предсказывать как слияние генов, так и неслитые гены и относящиеся к ним TSV  из данных выравнивания данных РНК- секвенирования.
Подробнее
0

НовостиОдин пакет to rule them all

В этой работе группа авторов из Йельской школы медицины представляет библиотеку Python, реализующую условные случайные поля (conditional random fields, CRF) - класс вероятностных графовых моделей, для прогнозирования этих конструктов из последовательностей.
Подробнее
0

НовостиCRISPR/Cas9 for Dummies


В текущем обзоре группа исследователей из Неаполитанского университета описывает и оценивает большинство доступных CRISPR / Cas9 подходов, описывающих механизмы действия, в дополнение к их преимуществам или недостаткам. Основная цель этой работы - служить руководством для начинающих исследователей.
Подробнее
0

НовостиНу где же ваши ядра?


В данной работе исследователи из института Броад Массачусетского технологического института и Гарварда представляют DroNc-Seq - новый метод секвенирования ядерной РНК с помощью технологии секвенирования одиночных клеток. 
Подробнее
0

НовостиИ еще один протокол для scRNA-Seq


 Исследователи из RIKEN Institute разработали высокопроизводительный метод РНК-секвенирования одиночных клеток, Quartz-Seq2, который обладает рядом конкурентных преимуществ по сравнению с существующими методами.

Подробнее
0