НовостиTROM: анализ без корреляции.


Исследователи из UCLA предлагают метод TROM (Transcriptome Overlap Measure), основанный на тестах, для сравнения транскриптомов внутри или между различными видами, который предоставляет другую метрику сравнения, в отличие от традиционных корреляционных методов анализа для выявления транскриптомного сходства.

Подробнее
0

НовостиТранскрипты из стали

В данной статье исследователи из Королевской детской больницы в Мельбурне, представляют понятие "супертранскрипты", заменяющие референсный геном, где каждый ген с несколькими транскриптами представлен одной последовательностью.
Подробнее
0

НовостиИскать микросателлиты в вебе

 
MISA - представляет собой инструмент для поиска микросателлитов в нуклеотидных последовательностях. Исследователи из Лейбницского института генетики растений и исследований растениеводческих растений представляют MISA-web, расширение для инструмента командной строки MISA, которое предоставляет графический пользовательский интерфейс и выходные данные в  формате GFF3.
Подробнее
0

НовостиГенные сети и кукуруза.


Исследователи из Университета штата Флорида оценивали параметры для нормализации данных экспрессии и построения различных видов генных сетей на основе анализа данных РНК-секвенирования кукурузы!
Подробнее
0

НовостиНе забудь посчитать изоформы!


В данном обзоре авторы провели всестороннюю оценку биоинформатических инструментов анализа изоформ транскриптов с использованием как экспериментальных, так и смоделированных наборов данных РНК-секвенирования.
Подробнее
0

НовостиБольшие данные для большой медицины


В этом обзоре авторы из Национального Института Инфекции а Аллергии выявляют несоответствия между нынешними подходами к управлению данными и необходимостью внедрения новых решений для управления большими данными, полученными в ходе масштабных исследований в сфере здравоохранения. Ориентируясь на эти неудовлетворенные потребности и общепризнанные проблемы, авторы рассматривают самые современные концепции, подходы и технологии для управления данными от вычислительных лабораторий и индустрии для изучения решений по их улучшению.
Подробнее
0

НовостиВидов РНК не бывает много.


Этот обзор поможет конечным пользователям и исследователям получить информацию о существующих базах данных и инструментах для работы с различными видами РНК, а также понять конкретные функции, которые они предлагают. 
Подробнее
0