Новости / СофтSimulome – симулятор геномов прокариот

Simulome – мощный и простой в использовании инструмент для создания псевдо-геномов прокариот как на основе реальных NGS данных, так и с симулированных NGS-ридов. Пользователю предоставлена возможность симулировать в любых комбинациях синонимичные/ несинонимичные мутации, SNP, инделы или дуплицирующиеся участки, а также регулировать селекционные критерии и структуру генов.


Подробнее
+1

НовостиПо следам распространения множественной лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis

Ни для кого не секрет, что бактерии становятся все менее восприимчивы к антибиотикам, в январе 2017 в США был зарегистрирован первый случай летального исхода от бактериальной инфекции, устойчивой даже к антибиотикам «последнего резерва», которые применяются лишь в тех случаях, когда выявлена резистентность ко всем остальным препаратам. Ситуация весьма плачевна и для людей, больных туберкулезом.

Подробнее
+4

НовостиЧем болеют митохондрии, и можно ли их вылечить?

Митохондриальные заболевания - группа наследственных патологий, приводящих к нарушению процесса окислительного фосфорилирования. Такие болезни вызываются мутациями в ядерных и митохондриальных генах, кодирующих белки, необходимые для нормального функционирования митохондрий.

Подробнее
+2

НовостиТёмная сторона протеома

Тёмная материя существует не только в астрофизике, но и в биологии. Мы до сих пор не знаем функции и происхождение огромного числа последовательностей в нашем собственном геноме. Кроме того, мы не знаем полную трёхмерную структуру, а значит и определяемые ей функциональные особенности, для половины известных эукариотических белков. Именно такие последовательности будут формировать тёмный протеом.

Подробнее
+2

Новости / СофтCART - Chemical Annotation Retrieval Toolkit

К настоящему времени существуют десятки миллионов различных лекарственных препаратов. Многие из них имеют несколько синонимичных названий. А поиск известных биохимических и сигнальных эффектов для какого-нибудь лекарства может стать достаточно сложной задачей. Поэтому группа исследователей из Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) под руководством Samy Deghou разработала программу CART. Пользователь вводит название интересующего препарата, а утилита выдаёт все его названия-синонимы, перечень известных побочных эффектов, влияние на метаболические и сигнальные пути и области примененния.


Подробнее
+2

НовостиУстановлена причина "синдрома нерасчёсывающихся волос"

"Синдром нерасчесываемых волос" - редкая аномалия структуры стержня волоса, как правило проявляющаяся у детей и чаще всего исчезающая с возрастом - примерно в 15 лет. При этом заболевании волосы - сухие, вьющиеся, соломенного цвета, и их невозможно причесать. В первые данный синдром был описан в 1973 году A. Dupré, P. Rochiccioli и J.L. Bonafé во Франции. Предположение о том, что болезнь генетически детерменирована, было высказывано уже давно, однако до сих пор не было обнаружено ни одного гена, вовлеченного в её возникновение.

Подробнее
+3

НовостиЗвучание белка - Squirell sounds

Не знаете, что послушать с утра? Весь плейлист уже наскучил? Тогда Robert P. Bywater из Института Фрэнсиса Крика и Jonathan N. Middleton из Университета Тампере могут предложить вам кое-что совсем новое! Исследователи решили, что мало визуализации третичной структуры белка, и неплохо было бы её послушать. Используя специальный алгоритм, они перевели в мелодию информацию о первичной и вторичной структурах, гидрофобности и растворимости трех белков. А дальше они решили узнать смогут ли испытуемые распознать какая мелодия соответствует тому или иному участку третичной структуры этих белков. Результат получился весьма неожиданным, - 73% участников эксперимента успешно справились с задачей. Теперь в планах исследователей "озвучить" и ДНК.

Подробнее
+3

НовостиКак ДНК из воды морской китовых акул считать помогала

Популяционно-генетические исследования необходимы для изучения и сохранения видов, находящихся под угрозой исчезновения. Однако, если вы имеете дело с редким видом, обитающим в океане, сбор матерала для анализа может оказаться непростой задачей. Но группа исследователей под руководством Eva Egelyng Sigsgaard из Музея Естественной истории Дании, анализируя выделенную из морской воды ДНК при помощи методов высокопроизводительного секвенирования, сумела не только определить степень гетерогенности популяции китовой акулы, но и оценить её численность.

Подробнее
+3

Новости / ГрантыКонкурс

Википедия стала одним из наиболее широко используемых источников научной информации в мире.Этот ресурс популярен как среди студентов, так и среди широкой общественности. С 2012 года ISCB проводит ежегодный конкурс статей Википедии, созданных студентами или стажерами, которые поддерживают образовательную миссию Общества вычислительной биологии (ISCB) и расширяют знания в области вычислительной биологии и биоинформатики в Википедии. Победители конкурса награждаются денежными призами, а также получают годовое членство в ISCB.

Подробнее
+2