Когда секвенирования одиночых клеток уже маловато.

Когда секвенирования одиночых клеток уже маловато.


источник


Новые методы одновременного количественного определения экспрессии белка и гена на уровне одиночной клетки обладают способностью идентифицировать типы клеток и классифицировать популяции клеток. В случае отдельной клетки поверхностные белки уникальны для конкретных типов клеток: например, CD3 для Т-клеток и CD19 для В-клеток. При наличии таких маркеров популяции клеток могут быть классифицированы на различные подтипы клеток, которые они содержат, в частности, с использованием анализа флуоресцентной активации клеток (FACS) с помощью групп антител. Однако за последние 5 лет появилась новая технология для характеризации популяций, известная как РНК-секвенирование одиночных клеток. Подобно FACS, клетки могут быть сгруппированы в соответствии с их транскриптомами, а типы клеток и субпопуляции становятся легко идентифицируемыми. Например, когда мы ранее изучали ткань поджелудочной железы у мыши и человека, мы идентифицировали 15 типов клеток и субпопуляции клеток протока поджелудочной железы. Однако было неизвестно, предоставили ли маркеры поверхности клеток и транскриптомы согласующуюся информацию. Как будут выявляться другие измеряемые величины? В конечном счете, кажется, что многие дополнительные идеи могут быть почерпнуты из одновременного анализа клеток  несколькими высокопроизводительными методами. 

Авторы работы попытались интегрировать измерения РНК-секвенирования одиночных клеток с секвенированием генома, профилирование белков, посттранскрипционной регуляцией, метаболомикой и липидомикой, а также клеточной локализацией каждого из них на уровне отдельных клеток. Такая полная характеристика клеток на уровне популяции была бы настоящей сокровищницей для понимания клеточной физиологии и патологических состояний.


Ссылка на статью

все для dle
0
Добавить комментарий

Оставить комментарий