Слежка за вирусами.

Слежка за вирусами.

 

источник


Клиницисты,  официальные представители системы здравоохранения и биомедицинские исследователи заинтересованы изучении эпидемиологического распространения патогенов как в пространстве, так и во времени, чтобы оптимизировать меры вмешательства и политику общественного здравоохранения. Большие базы данных  секвенирования вирусных последовательностей дают интересную возможность изучить это распространение посредством филогенетического анализа. Чтобы вывести знания из крупных филогенетических деревьев, потенциально охватывающих десятки тысяч вирусных штаммов, необходим эффективный метод исследования данных. Клады, которые рассматриваются в ходе этого исследования, должны быть аннотированы исходя из характеристик штамма (например, группа риска передачи, тропизм, профиль резистентности к лекарственным средствам) и их географическим контекстом.


PhyloGeoTool интерактивно реализует визуальный метод для изучения больших филогенетических деревьев и для описания характеристик штаммов и клад, включая их географический контекст. PhyloGeoTool также предоставляет возможность позиционировать новые вирусные штаммы по сравнению с существующим филогенетическим деревом, позволяя пользователям получить представление о размещении таких новых штаммов без необходимости проведения de novo реконструкции филогении.


Ссылка на репозиторий

Ссылка на статью

все для dle
0
Добавить комментарий

Оставить комментарий