Аннотации не бывает много.

Аннотации не бывает много.

 

источник


Секвенирование следующего поколения (NGS) стало основным методом мониторинга экспрессии генов параллельно с различными экспериментальными методами лечения. К сожалению,  на данный момент не существует веб-сервиса для всестороннего проведения дальнейшего анализа, основанного на огромном количестве имеющихся данных, полученных после завершения процесса аннотации генов. Поэтому для получения полезных результатов анализа транскриптомных данных генов и регуляторных путей требуется, удобная для пользователя и эффективная система. Инструмент EXPath был разработан для аннотации метаболических путей и сравнительного анализа профилей экспрессии генов, настроенных пользователем, полученных на экспрессионных микрочипах или NGS в различных условиях, чтобы вывести метаболические пути для всех организмов в базе данных KEGG. EXPath Tool содержит несколько функций: доступ к паттернам экспрессии генов и кандидатам генов ко-экспрессии, функциональная группировка с метаболическим путем и GO (анализ представленности / GO) и корреляционные сети (анализ коэкспрессии) экспрессии генов, участвующих в определенных метаболических путях, чтобы сделать вывод о последствиях лечения. 


Ссылка на скачивание

Ссылка на статью

все для dle
0
Добавить комментарий

Оставить комментарий