Хозяин и патоген выясняют отношения

Хозяин и патоген выясняют отношения

источник


Болезнь Марека - инфекционное лимфопролиферативное заболевание цыплят и типичная модель вирусного онкогенеза. Картирование изменений или разных состояний в ходе инфекции как для хозяина, так и для патогена предоставило бы важную информацию о динамических взаимодействиях хозяин-патоген. Исследователи из Университета Сунь Ят-сена разработали  новый метод на основе секвенирования РНК для исследования взаимодействия хозяин-патоген в клетках фибробластов куриных эмбрионов, зараженных вирусом болезни Марека. Этот метод позволяет точно профилировать экспрессию гена и альтернативные сайты полиаденилирования для хозяина и патогена одновременно. Авторы работы идентифицировали 476 дифференциально экспрессированных генов и 437 APA переключающих генов в хозяине, активирующая переключение в тандемных 3' UTR и (альтернативное полиаденилирование) переключение между кодирующей областью и 3' UTR. Большинство из этих генов были связаны с врожденным иммунитетом, апоптозом и метаболизмом, но два набора генов немного перекрывались, давая представление о двух дополнительных механизмах регуляции генов при инфекции Марека. Эти результаты дают относительно полное представление о динамических взаимодействиях хозяин - патоген в регуляции транскрипции генов во время заражения вирусом болезни Марека и предполагают, что представленный метод на основе секвенирования РНК является перспективным методом для исследования глобальных взаимодействий хозяин-патоген.

Ссылка на статью

все для dle
0
Добавить комментарий

Оставить комментарий