НовостиOmniPath

Исследователями из Великобритании и Германии была разработана платформа OmniPath для интеграции данных о сигнальных путях в клетках человека, в качестве источников были использованы 34 существующих базы данных о белок-белковых взаимодействиях.

Подробнее
0

Новости«Фармстандарт» вложил 1 млн долларов в «Генотек»

«Фармстандарт», крупнейший фармпроизводитель РФ, инвестировал 1 млн долларов в холдинг Genotek, который занимается ДНК-исследованиями. Сколковское подразделение Genotek, компания «Генотек ИТ», является резидентом IT-кластера Фонда

Подробнее
0

Новости / СофтТрекинг данио-рерио с помощью сверточных нейронных сетей

Системы глубокого обучения, например сверточные нейронные сети способны распознавать человеческие лица с низким уровнем ошибок. Zhiping Xu и Xi En Cheng применили сверточную нейронную сеть для идентификации и трекинга особей данио-рерио в аквариуме.

Подробнее
0

НовостиГенетические основы зонирования печеночных долек

Особенностью строения печеночной дольки является метаболическое зонирование: известно, что гепатоциты периферической зоны лучше снабжаются кислородом, чем гепатоциты центральной зоны, поэтому первые экспрессируют большое количество белков, участвующих в энергозатратных процессах – глюконеогенезе и синтезе мочевины, тогда как вторые специализируются на гликолизе и метаболизме ксенобиотиков.

Для лучшего понимания функционирования отдельных гепатоцитов группа ученых из института Вейцмана реконструировала полное зонирование печеночной дольки мыши по специфическим для печени генам, комбинируя секвенирование РНК одиночных клеток (MARS-seq) и флуоресцентную гибридизацию in situ для отдельных молекул (smFISH).

Подробнее
+1

Новости / РазноеПодборка занимательных статей на выходные

Для того чтобы не расслабляться на выходных, предлагаем к прочтению подборку статей, составленную редакторами журнала Genome biology - все самое читаемое, обсуждаемое и интересное за 2016 год.

Подробнее
+2

Новости / Курсы и семинарыКурс "Введение в биоинформатику: метагеномика" на национальной платформе

Cегодня на российской национальной платформе Открытое образование начитается курс "Введение в биоинформатику: метагеномика".
Подробнее
+2

Новости / СофтSimulome – симулятор геномов прокариот

Simulome – мощный и простой в использовании инструмент для создания псевдо-геномов прокариот как на основе реальных NGS данных, так и с симулированных NGS-ридов. Пользователю предоставлена возможность симулировать в любых комбинациях синонимичные/ несинонимичные мутации, SNP, инделы или дуплицирующиеся участки, а также регулировать селекционные критерии и структуру генов.


Подробнее
+1

СобытияХакатон по биоинформатике BioHack 3 – 5 марта, Санкт-Петербург

3-5 марта в Санкт-Петербурге пройдет хакатон по биоинформатике BioHack. Регистрация участников и проектов заканчивается 21 февраля, так что сейчас самое время подать заявку на участие!

Подробнее
0